Adiunkt K/M -nauki biologiczne Małopolskie Centrum Biotechnologii

Projekt ERC Advanced IN and OUT, pn. In with the good, out with the bad: understanding small molecule influx and efflux in gut Opis Programu/Projektu Ludzki mikrobiom jelitowy wywiera ogromny wpływ na wiele aspektów zdrowia człowieka. Rodzaj Bacteroides należy do Gram-ujemnych bakterii z gromady Bacteroidetes i jest najliczniej reprezentowanym rodzajem bakterii w jelitach populacji zachodnich. Bakterie Bacteroides wzbudzają duże zainteresowanie ze względu na swoją zdolność do wykorzystywania złożonych polisacharydów pochodzących z diety, które nie mogą być trawione przez gospodarza (błonnik). Jednak sama zdolność rozkładu błonnika prawdopodobnie nie wyjaśnia dominacji Bacteroides, szczególnie biorąc pod uwagę ubogie w błonnik diety charakterystyczne dla społeczeństw zachodnich. Ponieważ zarówno mikroorganizmy jelitowe, jak i komórki nabłonka jelitowego podlegają bardzo intensywnej wymianie, w jelicie znajduje się wiele źródeł składników odżywczych niezależnych od diety. Stawiamy hipotezę, że bakterie Bacteroides ewoluowały w kierunku efektywnego wykorzystywania tych zasobów. Jednocześnie związki szkodliwe dla komórki, takie jak kwasy żółciowe i antybiotyki, muszą być z niej usuwane. Wszystkie te procesy w dużej mierze zależą od lipoprotein, kanałów i transporterów zlokalizowanych w zewnętrznej błonie komórkowej (OM, ang. outer membrane) bakterii. Finansowany przez Unię Europejską projekt IN and OUT ma na celu identyfikację nowych mechanizmów transportu przez błonę zewnętrzną bakterii jelitowych z rodzaju Bacteroides. Wykorzystując interdyscyplinarne podejście badawcze, projekt dąży do wyjaśnienia, dlaczego ten rodzaj bakterii osiąga tak dużą liczebność w ludzkim jelicie. W przeciwieństwie do Proteobacteria, takich jak Escherichia coli, u których procesy transportu przez błonę zewnętrzną zostały szczegółowo poznane, mechanizmy te u filogenetycznie odległych bakterii Bacteroides pozostają w dużej mierze nieodkryte. Pierwszy obszar projektu (INFLUX) koncentruje się na pozyskiwaniu obfitych składników odżywczych dostępnych w jelicie, takich jak białka, peptydoglikan, kwasy nukleinowe i lipidy. Drugi obszar (EFFLUX) poświęcony jest badaniu pomp eksportujących, które odgrywają istotną rolę w usuwaniu z komórki toksycznych związków, takich jak antybiotyki i leki stosowane u ludzi. W obu obszarach projektu zostaną odkryte nowe mechanizmy biologiczne, które przyczynią się do lepszego zrozumienia, dlaczego rodzaj Bacteroides jest tak licznie reprezentowany w ludzkim jelicie. Zakres obowiązków wg Regulaminu Pracy UJ Załącznik nr 1 do Regulaminu pracy Uniwersytetu Jagiellońskiego link do regulaminu https://cso.uj.edu.pl/documents/54627/155219515/zarz_3_2024.pdf/ffbbcb5d-f7f7-4f72-8b95-b973939799ec Benefity Zakładowy Fundusz Świadczeń Socjalnych (w zależności od przychodu na członka rodziny, zgodnie z Regulaminem przyznawania świadczeń z ZFŚS): - dofinansowanie do wypoczynku letniego (1.050-1.550 zł brutto) i zimowego (700-900 zł brutto), -dofinansowanie dla dzieci do wypoczynku zorganizowanego (900-1.400 zł brutto) lub dofinansowanie do kolonii, obozów, zimowisk, wczasów leczniczych i turnusów rehabilitacyjnych wykupionych indywidualnie (50-90%, maksymalna kwota, do której przysługuje dofinansowanie, wynosi 2.500 zł brutto) na każde dziecko, - ekwiwalent pieniężny za okolicznościową paczkę ze słodyczami w wysokości 100-300 zł brutto na każde dziecko, - dofinansowanie do opieki nad dziećmi w żłobkach, przedszkolach oraz innych formach wychowania przedszkolnego, a także usług opieki sprawowanej przez dziennego opiekuna lub nianię (250-400 zł brutto). Wymagania: wykształcenie - wyższe (w tym licencjat), kierunek: doktorat z mikrobiologii zawód - Nauczyciel akademicki – nauki ścisłe i przyrodnicze język obcy - angielski, w mowie: C2 - biegły, w piśmie: C2 - biegły Wymagane kwalifikacje: Stopień doktora w dziedzinie mikrobiologii, biologii strukturalnej lub pokrewnej dyscyplinie, np. biofizyki lub biochemii. Minimum 12 miesięcy doświadczenia badawczego zdobytego poza krajem pochodzenia oraz co najmniej 12 miesięcy doświadczenia w międzynarodowym środowisku badawczym w obszarze biologii strukturalnej lub mikrobiologii. Udokumentowany dorobek publikacyjny w recenzowanych czasopismach naukowych o wysokim współczynniku wpływu. Szczególnie preferowani będą Kandydaci (K/M) posiadający publikacje jako pierwszy autor lub pierwszy współautor w czołowych czasopismach. Udowodniona zdolność do pisania i prowadzenia wysokiej jakości publikacji naukowych w prestiżowych czasopismach (np. z portfolio Nature). Bardzo duże doświadczenie w zakresie mikrobiologii, preferowane doświadczenie związane z hodowlą bakterii beztlenowych. Znajomość technik kriomikroskopii elektronowej (cryo-EM), a dokładniej analizy pojedynczych cząstek, a także krystalografii rentgenowskiej i modelowania molekularnego. Udokumentowana umiejętność przygotowywania wizualizacji złożonych koncepcji biologicznych w standardzie publikacyjnym najwyższej klasy cz